Hans-Jörg Bullinger war von 2002 bis 2012 Präsident der Fraunhofer-Gesellschaft in München. Die Fraunhofer-Gesellschaft fördert und betreibt anwendungsorientierte Forschung zum unmittelbaren Nutzen für die Wirtschaft und zum Vorteil für die Gesellschaft. Hans-Jörg Bullinger stellte die Weichen dafür, dass die Fraunhofer Gesellschaft immer mehr zum wichtigen Motor für technische Innovationen im Feld der nachhaltigen Entwicklung wurde. Als Präsident der Fraunhofer-Gesellschaft verstand sich Hans-Jörg Bullinger als Lobbyist für mehr Investitionen in Forschung und Entwicklung, als Brückenbauer zwischen Wissenschaft und Wirtschaft und als Vordenker künftiger gesellschaftlicher Entwicklungen. Seine Devise: Forschung muss immer klar auf den Menschen als Maß der Technik ausgerichtet sein. Seine Erfahrung brachte Hans-Jörg Bullinger, der als einer der profiliertesten Politikberater im Bereich Wissenschaft gilt, auch in den im Mai 2006 gegründeten zwölfköpfigen "Rat für Innovation und Wachstum" ein, der Bundeskanzlerin Angela Merkel in Zukunftsfragen beriet.